E’ stato condotto uno studio di associazione sull’intero genoma per identificare gli alleli associati al rischio di sclerosi multipla.
La tecnologia del DNA microarray è stata utilizzata per identificare varianti comuni di sequenza di DNA in 931 famiglie trio ( costituite da un figlio affetto dalla malattia e da entrambi i genitori ) e le stesse sono state valutate per associazione. Per le repliche sono stati genotipate altre 609 famiglie trio, 2.322 soggetti caso e 789 soggetti controllo e sono stati inoltre utilizzati i dati di due data set esterni di controllo.
E’ stata condotta un’analisi congiunta su 12.360 soggetti.
Un test TDT ( Transmission Disequilibrium Test ) su 334.923 polimorfismi a singolo nucleotide ( SNP ) in 931 famiglie trio ha rivelato 49 SNP, che mostravano un’associazione con la sclerosi multipla ( P
Un confronto tra i 923 soggetti caso provenienti dalle famiglie trio e 2.431 soggetti di controllo ha permesso di identificare altri 32 SNP non identificati in precedenza ( P
Sono stati inoltre selezionati altri 40 SNP con P value < 0.01 per un totale di 110 SNP per una analisi di secondo livello. Tra questi SNP, 2 all’interno del gene del recettore dell’interleuchina 2 ( IL2RA ) sono risultati fortemente associati alla sclerosi multipla ( P=2.96x10–8 ), così come un SNP non sinonimo nel gene del recettore dell’interleuchina 7 ( IL7RA ) ( P=2.94x10–7 ) e SNP multipli nel locus HLA-DRA ( P=8.94x10–81 ).
In conclusione, gli alleli di IL2RA e di IL7RA e nel locus HLA sono stati identificati come fattori di rischio ereditari per la sclerosi multipla. ( Xagena2007 )
The International Multiple Sclerosis Genetics Consortium N Engl J Med 2007; 357: 851-862
Neuro2007
